Pakiet: parallel-fastq-dump (0.6.7-3)

[ Pakiet źródłowy: parallel-fastq-dump  ]

parallel fastq-dump wrapper

NCBI fastq-dump can be very slow sometimes, even if you have the resources (network, IO, CPU) to go faster, even if you already downloaded the sra file. This tool speeds up the process by dividing the work into multiple threads.

This is possible because fastq-dump have options (-N and -X) to query specific ranges of the sra file, this tool works by dividing the work into the requested number of threads, running multiple fastq-dump in parallel and concatenating the results back together, as if you had just executed a plain fastq-dump call.

Inne pakiety związane z parallel-fastq-dump

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• dep: sra-toolkit

  utilities for the NCBI Sequence Read Archive

Pobieranie parallel-fastq-dump

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	5,5 KiB	24,0 KiB	[lista plików]
arm64	5,5 KiB	24,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	5,5 KiB	24,0 KiB	[lista plików]