Pakiet: tombo (1.5.1-6) [debports]

[ Pakiet źródłowy:  ]

Identyfikacja zmodyfikowanych nukleotydów z surowych danych sekwencjonowania nanoporów

Tombo to zestaw narzędzi służących przede wszystkim do identyfikacji zmodyfikowanych nukleotydów z danych sekwencjonowania nanoporów. Tombo zapewnia również narzędzia do analizy i wizualizacji surowego sygnału nanoporów.

Inne pakiety związane z tombo

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1)

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-mappy

  Python3 interface minimap2

• dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0)

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-numpy-abi9

  pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

• dep: python3-pkg-resources

  Wykrywanie pakietów i udostępnianie zasobów przy użyciu pkg_resources

• dep: python3-scipy

  Narzędzia naukowe dla Pythona 3

• dep: python3-tqdm

  fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

• rec: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• rec: python3-rpy2

  Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)

Pobieranie tombo

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
m68k (port nieoficjalny)	463,3 KiB	1 642,0 KiB	[lista plików]