Pakiet: libquicktree-dev (2.5-6 i inne)

[ Pakiet źródłowy: quicktree  ]

Neighbor-Joining algorithm for phylogenies (development)

QuickTree is an efficient implementation of the Neighbor-Joining algorithm (PMID: 3447015), capable of reconstructing phylogenies from huge alignments in time less than the age of the universe.

QuickTree accepts both distance matrix and multiple-sequence-aligment inputs. The former should be in PHYLIP format. The latter should be in Stockholm format, which is the native alignment format for the Pfam database. Alignments in various formats can be converted to Stockholm format with the sreformat program, which is part of the HMMer package (hmmer.org).

The tress are written to stdout, in the Newick/New-Hampshire format use by PHYLIP and many other programs

This package contains some header files from quicktree that are used by other packages.

Znaczniki: Rozwój oprogramowania: Biblioteki, Rola: Biblioteka deweloperska

Pobieranie libquicktree-dev

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	2.5-6	27,8 KiB	151,0 KiB	[lista plików]
amd64	2.5-6	25,5 KiB	122,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.5-6	24,6 KiB	122,0 KiB	[lista plików]
armel	2.5-6	23,1 KiB	109,0 KiB	[lista plików]
armhf	2.5-6	22,6 KiB	100,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	2.5-6	24,6 KiB	111,0 KiB	[lista plików]
i386	2.5-6	26,2 KiB	116,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	2.5-6	29,6 KiB	152,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	2.5-6	22,1 KiB	106,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2.5-6	26,7 KiB	140,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	2.5-6	28,0 KiB	136,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2.5-6	28,2 KiB	133,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2.5-6+b1	43,1 KiB	341,0 KiB	[lista plików]
s390x	2.5-6	25,5 KiB	124,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	2.5-6	24,6 KiB	102,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	2.5-6	23,5 KiB	122,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	2.5-6	25,5 KiB	113,0 KiB	[lista plików]