Pakiet: libfastahack-dev (1.0.0+dfsg-11 i inne)

[ Pakiet źródłowy: libfastahack  ]

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (devel)

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features:

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

This is the development package containing the statically linked library and the header files.

Znaczniki: Rozwój oprogramowania: Biblioteki, Rola: Biblioteka deweloperska

Inne pakiety związane z libfastahack-dev

• dep: libfastahack0 (= 1.0.0+dfsg-11) [nie riscv64]

  library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

  dep: libfastahack0 (= 1.0.0+dfsg-11+b1) [riscv64]

Pobieranie libfastahack-dev

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11	29,4 KiB	170,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.0.0+dfsg-11	27,8 KiB	120,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.0.0+dfsg-11	26,1 KiB	118,0 KiB	[lista plików]
armel	1.0.0+dfsg-11	27,0 KiB	109,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.0.0+dfsg-11	27,1 KiB	96,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11	27,6 KiB	99,0 KiB	[lista plików]
i386	1.0.0+dfsg-11	29,3 KiB	104,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11	33,3 KiB	165,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11	26,3 KiB	100,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.0.0+dfsg-11	29,1 KiB	140,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11	28,0 KiB	125,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.0.0+dfsg-11	28,2 KiB	124,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.0.0+dfsg-11+b1	82,2 KiB	721,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.0.0+dfsg-11	27,5 KiB	121,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11	29,9 KiB	97,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11	23,5 KiB	111,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.0.0+dfsg-11	27,7 KiB	102,0 KiB	[lista plików]