Pakiet: kalign (1:3.5.1-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: kalign  ]

Globalne i progresywne dopasowywanie wielu sekwencji

Kalign jest narzędziem wiersza poleceń do przeprowadzenia wielokrotnego dopasowywania sekwencji biologicznych. Wykorzystuje algorytm dopasowywania ciągów Mutha-Manbera do poprawiania zarówno dokładności, jak i szybkości wyrównywania. Program wykorzystuje globalne, progresywne podejście do dopasowywania, wzbogacone o zastosowanie przybliżonego algorytmu dopasowywania ciągów do obliczania odległości sekwencji oraz poprzez włączenie lokalnych dopasowań do globalnego wyrównywania.

Znaczniki: Biologia: Clustal/ALN, Białka, Dziedzina: field::biology, field::biology:bioinformatics, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::comparing, works-with-format::plaintext, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z kalign

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, loong64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.42) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• enh: bioperl-run

  Nakładki na BioPerl: skrypty

• enh: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie kalign

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1:3.4.0-1+b2	85,7 KiB	409,0 KiB	[lista plików]
amd64	1:3.5.1-1	196,3 KiB	1 509,0 KiB	[lista plików]
arm64	1:3.5.1-1	117,8 KiB	474,0 KiB	[lista plików]
armhf	1:3.5.1-1	104,5 KiB	344,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1:3.5.1-1	112,6 KiB	416,0 KiB	[lista plików]
i386	1:3.5.1-1	122,6 KiB	443,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1:3.4.0-1	105,1 KiB	557,0 KiB	[lista plików]
loong64	1:3.5.1-1	126,0 KiB	537,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1:3.5.1-1	104,8 KiB	375,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1:3.5.1-1	129,1 KiB	538,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1:3.5.1-1	138,5 KiB	602,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1:3.4.0-1+b3	88,2 KiB	287,0 KiB	[lista plików]
s390x	1:3.5.1-1	130,8 KiB	474,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1:3.5.1-1	124,2 KiB	408,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1:3.5.1-1	101,0 KiB	2 140,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1:3.5.1-1	123,5 KiB	424,0 KiB	[lista plików]