Pakiet: garli-mpi (2.1-7 i inne)

[ Pakiet źródłowy: garli  ]

phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood (MPI)

GARLI, Genetic Algorithm for Rapid Likelihood Inference is a program for inferring phylogenetic trees. Using an approach similar to a classical genetic algorithm, it rapidly searches the space of evolutionary trees and model parameters to find the solution maximizing the likelihood score. It implements nucleotide, amino acid and codon-based models of sequence evolution, and runs on all platforms. The latest version adds support for partitioned models and morphology-like datatypes.

This version of Garli is using MPI.

Inne pakiety związane z garli-mpi

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libncl2 (>= 2.1.18) [amd64]

  NEXUS Class Library

  dep: libncl2 (>= 2.1.21+git20210811.b1213a7) [nie amd64]

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

Pobieranie garli-mpi

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	2.1-7+b1	619,2 KiB	1 685,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.1-7+b1	551,0 KiB	1 493,0 KiB	[lista plików]
armel	2.1-7+b1	513,8 KiB	1 376,0 KiB	[lista plików]
armhf	2.1-7+b1	488,1 KiB	952,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	2.1-7+b1	591,1 KiB	1 508,0 KiB	[lista plików]
i386	2.1-7+b1	547,4 KiB	1 580,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	2.1-7+b1	937,5 KiB	3 298,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	2.1-7+b1	519,4 KiB	1 604,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2.1-7+b1	592,0 KiB	1 849,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	2.1-7+b1	631,8 KiB	1 813,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2.1-7+b1	685,6 KiB	1 813,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2.1-7+b2	646,5 KiB	1 285,0 KiB	[lista plików]
s390x	2.1-7+b1	499,3 KiB	1 589,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	2.1-7+b1	673,2 KiB	1 430,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	2.1-7+b1	519,3 KiB	2 080,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	2.1-7+b1	621,0 KiB	1 644,0 KiB	[lista plików]