Pakiet: flye (2.9.3+dfsg2-1)

[ Pakiet źródłowy: flye  ]

de novo assembler for single molecule sequencing reads using repeat graphs

Flye is a de novo assembler for single molecule sequencing reads, such as those produced by PacBio and Oxford Nanopore Technologies. It is designed for a wide range of datasets, from small bacterial projects to large mammalian-scale assemblies. The package represents a complete pipeline: it takes raw PacBio / ONT reads as input and outputs polished contigs. Flye also has a special mode for metagenome assembly.

Inne pakiety związane z flye

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie alpha, ia64, riscv64]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: minimap2

  versatile pairwise aligner for genomic and spliced nucleotide sequences

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• dep: python3-six

  Python 2 and 3 compatibility library

• dep: samtools

  Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie flye

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	22 589,8 KiB	37 051,0 KiB	[lista plików]
amd64	22 636,3 KiB	36 913,0 KiB	[lista plików]
arm64	22 561,7 KiB	36 792,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	22 763,6 KiB	38 428,0 KiB	[lista plików]
mips64el	22 557,3 KiB	37 103,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	22 630,0 KiB	37 241,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	22 638,2 KiB	37 176,0 KiB	[lista plików]
riscv64	22 615,6 KiB	36 508,0 KiB	[lista plików]
s390x	22 668,3 KiB	37 096,0 KiB	[lista plików]