Pakiet: fastaq (3.17.0-6)

Odnośniki dla fastaq

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego fastaq:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

Narzędzia do obsługi plików FASTA i FASTQ

Fastaq reprezentuje zróżnicowaną kolekcję skryptów, które wykonują przydatne i typowe zadania operacyjne na FASTA/FASTQ, takie jak: filtrowanie, łączenie, dzielenie, sortowanie, przycinanie, wyszukiwanie/zastępowanie itp. Pliki wejściowe i wyjściowe można spakować programem gzip (format wykrywany jest automatycznie), a poszczególne polecenia Fastaq mogą być przesyłane razem.

Znaczniki: Biologia: Fasta/Pearson, Kwasy nukleinowe, Dziedzina: field::biology, field::biology:bioinformatics, Zaimplementowane w: implemented-in::python, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::analysing, use::calculating, Sprawdzanie, Konwersja danych, use::filtering, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z fastaq

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
dep: python3-pkg-resources

Wykrywanie pakietów i udostępnianie zasobów przy użyciu pkg_resources
dep: samtools

Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

Pobieranie fastaq

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	46,4 KiB	195,0 KiB	[lista plików]