Pakiet: bwa (0.7.17-7 i inne)

[ Pakiet źródłowy: bwa  ]

Burrows-Wheeler Aligner

BWA is a software package for mapping low-divergent sequences against a large reference genome, such as the human genome. It consists of three algorithms: BWA-backtrack, BWA-SW and BWA-MEM. The first algorithm is designed for Illumina sequence reads up to 100bp, while the rest two for longer sequences ranged from 70bp to 1Mbp. BWA-MEM and BWA-SW share similar features such as long-read support and split alignment, but BWA-MEM, which is the latest, is generally recommended for high-quality queries as it is faster and more accurate. BWA-MEM also has better performance than BWA-backtrack for 70-100bp Illumina reads.

Znaczniki: Biologia: Białka, Dziedzina: Biologia, field::biology:bioinformatics, implemented-in::c, Interfejs użytkownika: Wiersz poleceń, interface::text-mode, role::program, Przeznaczenie: Analizowanie, Porównywanie

Inne pakiety związane z bwa

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

• rec: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• sug: samtools

  Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

Pobieranie bwa

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	0.7.17-7+b5	206,9 KiB	513,0 KiB	[lista plików]
amd64	0.7.17-7+b3	207,3 KiB	453,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.7.17-7+b3	189,1 KiB	449,0 KiB	[lista plików]
armel	0.7.17-7+b3	190,8 KiB	432,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.7.17-7+b3	190,0 KiB	320,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	0.7.17-7+b3	226,4 KiB	513,0 KiB	[lista plików]
i386	0.7.17-7+b3	230,1 KiB	520,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	0.7.17-7+b4	280,4 KiB	925,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	0.7.17-7+b3	204,7 KiB	472,0 KiB	[lista plików]
mips64el	0.7.17-7+b3	201,0 KiB	528,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	0.7.17-7+b3	218,1 KiB	577,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.7.17-7+b3	228,6 KiB	577,0 KiB	[lista plików]
riscv64	0.7.17-7+b3	214,5 KiB	376,0 KiB	[lista plików]
s390x	0.7.17-7+b3	220,3 KiB	509,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	0.7.17-7+b3	273,6 KiB	449,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	0.7.17-7+b3	182,7 KiB	1 093,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	0.7.17-7+b3	218,9 KiB	468,0 KiB	[lista plików]