Pakiet: bcftools (1.20-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: bcftools  ]

Wywoływanie wariantów genomowych oraz zarządzanie plikami VCF i BCF

BCFtools to zestaw narzędzi, które manipulują wywołaniami wariantowymi w formacie Variant Call Format (VCF) i jego binarnym odpowiedniku BCF. Wszystkie polecenia działają w sposób przejrzysty zarówno z plikami VCF, jak i BCF, zarówno nieskompresowanymi, jak i skompresowanymi przy użyciu BGZF.

Znaczniki: Zaimplementowane w: C, Rola: Program

Inne pakiety związane z bcftools

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3-gffutils [nie alpha, x32]

  Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

• dep: python3-matplotlib [nie alpha, x32]

  Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)

• dep: sse2-support [i386]

  CPU feature checking - require SSE2

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

• rec: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• sug: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• sug: python3-matplotlib [alpha, x32]

  Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)

• sug: python3-numpy

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• sug: texlive-latex-recommended

  TeX Live: LaTeX recommended packages

Pobieranie bcftools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.19-1+b1	702,5 KiB	4 227,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.20-1	742,1 KiB	2 632,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.20-1	667,7 KiB	4 035,0 KiB	[lista plików]
armel	1.20-1	657,0 KiB	2 359,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.20-1	654,5 KiB	1 824,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.20-1	758,3 KiB	2 509,0 KiB	[lista plików]
i386	1.20-1	784,0 KiB	2 728,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.20-1	909,4 KiB	4 403,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.20-1	643,7 KiB	2 246,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.20-1	676,3 KiB	4 355,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.20-1	761,0 KiB	4 583,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.20-1	777,7 KiB	4 610,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.20-1	735,6 KiB	2 184,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.20-1	766,4 KiB	2 739,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.20-1	797,6 KiB	3 854,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.20-1	726,2 KiB	42 439,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.19-1+b1	716,7 KiB	2 361,0 KiB	[lista plików]