wszystkie opcje
stretch  ] [  buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: barrnap  ]

Pakiet: barrnap (0.9+dfsg-2)

Odnośniki dla barrnap

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego barrnap:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

rapid ribosomal RNA prediction

Barrnap (BAsic Rapid Ribosomal RNA Predictor) predicts the location of ribosomal RNA genes in genomes. It supports bacteria (5S,23S,16S), archaea (5S,5.8S,23S,16S), mitochondria (12S,16S) and eukaryotes (5S,5.8S,28S,18S).

It takes FASTA DNA sequence as input, and writes GFF3 as output. It uses the NHMMER tool that comes with HMMER 3.1 for HMM searching in RNA:DNA style. Multithreading is supported and one can expect roughly linear speed-ups with more CPUs.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::perl, interface::commandline, Rola: Program, Przeznaczenie: use::searching, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z barrnap

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie barrnap

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
all 199,3 KiB1 440,0 KiB [lista plików]