Pakiet: scoary (1.6.16-6)

[ Pakiet źródłowy: scoary  ]

pangenome-wide association studies

Scoary is designed to take the gene_presence_absence.csv file from Roary as well as a traits file created by the user and calculate the associations between all genes in the accessory genome and the traits. It reports a list of genes sorted by strength of association per trait.

Inne pakiety związane z scoary

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

  dep: python3 (>= 3.2)

• dep: python3-pkg-resources

  Wykrywanie pakietów i udostępnianie zasobów przy użyciu pkg_resources

• dep: python3-scipy

  scientific tools for Python 3

• sug: roary

  high speed stand alone pan genome pipeline

Pobieranie scoary

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	229,5 KiB	2 686,0 KiB	[lista plików]