Pakiet: prokka (1.14.6+dfsg-6)
Odnośniki dla prokka
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego prokka:
Opiekunowie:
- Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
- Michael R. Crusoe (Strona QA)
- Andreas Tille (Strona QA)
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [github.com]
Podobne pakiety:
rapid annotation of prokaryotic genomes
A typical 4 Mbp genome can be fully annotated in less than 10 minutes on a quad-core computer, and scales well to 32 core SMP systems. It produces GFF3, GBK and SQN files that are ready for editing in Sequin and ultimately submitted to Genbank/DDJB/ENA.
Inne pakiety związane z prokka
|
|
|
|
-
- dep: aragorn
- tRNA and tmRNA detection in nucleotide sequences
-
- dep: default-jre
- Standard Java or Java compatible Runtime
-
- dep: hmmer
- profile hidden Markov models for protein sequence analysis
-
- dep: infernal
- Wyrównywanie drugorzędowej struktury RNA
-
- dep: less
- Program do stronicowania plików, podobny do more
-
- dep: libbio-perl-perl
- BioPerl core perl modules
-
- dep: libbio-searchio-hmmer-perl
- perl parser for HMMER2 and HMMER3 output (hmmscan, hmmsearch, hmmpfam)
-
- dep: libswiss-perl
- Perl API to the UniProt database
-
- dep: libxml-simple-perl
- Perl module for reading and writing XML
-
- dep: ncbi-blast+
- next generation suite of BLAST sequence search tools
-
- dep: ncbi-tools-bin
- NCBI libraries for biology applications (text-based utilities)
-
- dep: parallel
- build and execute command lines from standard input in parallel
-
- dep: perl
- praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla
-
- dep: prodigal
- Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program
Pobieranie prokka
Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
---|---|---|---|
all | 14 855,6 KiB | 106 501,0 KiB | [lista plików] |