Pakiet: bedtools (2.31.1+dfsg-3) [debports]

[ Pakiet źródłowy:  ]

Zestaw narzędzi do porównywania cech genomicznych

Narzędzia BEDTools umożliwiają wykonywanie typowych zadań genomicznych, takich jak: wyszukiwanie nakładających się cech i obliczanie pokrycia. Narzędzia te w dużej mierze bazują na czterech powszechnie używanych formatach plików: BED, GFF/GTF, VCF i SAM/BAM. Za pomocą BEDTools można tworzyć zaawansowane procesy badawcze, które pozwalają na uzyskiwanie odpowiedzi na skomplikowane pytania naukowe poprzez strumieniowe łączenie kilku narzędzi BEDTools.

Narzędzie groupBy jest dostępne w pakiecie filo.

Inne pakiety związane z bedtools

• dep: libbz2-1.0

  Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa

• dep: libc6.1 (>= 2.38)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  Biblioteka do kompresji w formacie XZ

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie bedtools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	609,0 KiB	2 332,0 KiB	[lista plików]