Pakiet: sibsim4 (0.20-5 i inne)

[ Pakiet źródłowy: sibsim4  ]

Wyrównywanie wyrażonych sekwencji RNA na matrycy DNA

Projekt SIBsim4 opiera się na sim4, programie zaprojektowanym w celu wyrównania wyrażonej sekwencji DNA do sekwencji genomowej, uwzględniając introny. SIBsim4 jest dość obszerną przeróbką oryginalnego kodu, mającą na celu:

 * poprawę szybkości;
 * umożliwienie stosowania dużych sekwencji DNA na skalę chromosomów;
 * dostarczenie bardziej szczegółowych danych wyjściowych na temat
   typów połączeń;
 * dostarczenie bardziej szczegółowych danych wyjściowych na temat
   miejsc polyA;
 * oczyszczenie i naprawienie różnego rodzaju błędów w kodzie.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::TODO, use::comparing, Wyszukiwanie, Obsługa formatu: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z sibsim4

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.34) [arm64, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386, s390x]

Pobieranie sibsim4

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	0.20-5	29,7 KiB	73,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.20-5+b2	28,4 KiB	85,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.20-5	26,2 KiB	56,0 KiB	[lista plików]
i386	0.20-5	30,8 KiB	80,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.20-5	31,9 KiB	85,0 KiB	[lista plików]
riscv64	0.20-5+b1	30,7 KiB	65,0 KiB	[lista plików]
s390x	0.20-5	30,5 KiB	77,0 KiB	[lista plików]