Pakiet: nanofilt (2.8.0-1)

[ Pakiet źródłowy: nanofilt  ]

Filtrowanie i przycinanie danych z sekwencjonowania długich odczytów

Nanofilt służy do filtrowana i przycinania danych z sekwencjonowania długich odczytów. Zapewnia filtrowanie według jakości i/lub długości odczytu oraz opcjonalne przycinanie po przefiltrowaniu. Odczytuje on dane ze standardowego wejścia i zapisuje je na standardowym wyjściu. Opcjonalnie odczytuje dane bezpośrednio z nieskompresowanego pliku określonego w wierszu poleceń.

Przeznaczony do użycia:

 1. bezpośrednio po ekstrakcji fastq;
 2. przed mapowaniem;
 3. w strumieniu pomiędzy ekstrakcją i mapowaniem.

Inne pakiety związane z nanofilt

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• dep: python3-biopython

  Python3 library for bioinformatics

• dep: python3-pandas

  data structures for "relational" or "labeled" data

Pobieranie nanofilt

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	12,1 KiB	49,0 KiB	[lista plików]