Pakiet: jalview (2.11.5.0+dfsg-1)

[ Pakiet źródłowy: jalview  ]

Edytor wielu wyrównań

JalView jest edytorem sekwencji DNA, RNA i białek napisanym w języku Java, który może obsługiwać sekwencje wyrównywane przez programy implementujące algorytmy wyrównywania, takie jak: Clustalw, Kalign i t-coffee.

Posiada mnóstwo funkcji, jest aktywnie rozwijany i będzie wypadał korzystnie w porównaniu do BioEdit, a przy tym jest darmowy w sensie wolności słowa!

Inne pakiety związane z jalview

• dep: debconf

  System zarządzania konfiguracją Debiana.

• dep: debconf (>= 0.5)

  System zarządzania konfiguracją Debiana.

  lub debconf-2.0

  pakiet wirtualny udostępniany przez cdebconf, cdebconf-udeb, debconf

• dep: default-jre

  Standard Java or Java compatible Runtime

• dep: groovy

  Agile dynamic language for the Java Virtual Machine

• dep: javahelp2

  Java based help system

• dep: libandroid-json-org-java

  androids rewrite of the evil licensed json.org

• dep: libapache-mime4j-java

  MIME and RFC822 parser for Java

• dep: libaxis-java

  SOAP implementation in Java

• dep: libbiojava6-java

  Java API to biological data and applications (version 6)

• dep: libcommons-discovery-java

  Locates classes that implement a given Java interface

• dep: libcommons-math3-java

  Java lightweight mathematics and statistics components

• dep: libhtsjdk-java

  Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats

• dep: libhttpclient-java

  HTTP/1.1 compliant HTTP agent implementation

• dep: libhttpcore-java

  set of low level HTTP transport components for Java

• dep: libhttpmime-java

  HTTP/1.1 compliant HTTP agent implementation - MIME extension

• dep: libintervalstorej-java

  Java implementation of the Nested Containment List data structure

• dep: libjaba-client-java

  minimal client for the JABAWS server

• dep: libjaxb-api-java

  Java Architecture for XML Binding API

• dep: libjaxb-java

  JAXB Reference Implementation

• dep: libjaxrs-api-java

  Java API for RESTful Services (JAX-RS)

• dep: libjaxws-java

  JAX-WS Reference Implementation (Library)

• dep: libjersey1-client-java

  RESTful Web Services in Java (client module)

• dep: libjersey1-core-java

  RESTful Web Services in Java (core library)

• dep: libjetty9-java

  Java servlet engine and webserver -- core libraries

• dep: libjfreesvg-java

  Java graphics library to generate content in SVG format

• dep: libjmol-java

  Java library for molecular structures

• dep: libjson-simple-java

  Simple, lightweight and efficient JSON toolkit for Java

• dep: libjsoup-java

  Java HTML parser that makes sense of real-world HTML soup

• dep: libjswingreader-java

  RSS NewsFeed reader for Java

• dep: liblog4j1.2-java

  Logging library for java

• dep: liblog4j2-java

  Apache Log4j - Logging Framework for Java

• dep: libmiglayout-java

  Java Layout Manager

• dep: libslf4j-java

  Simple Logging Facade for Java

• dep: libvamsas-client-java

  library for phylogenetic tasks

• dep: varna

  Visualization Applet for RNA

• sug: clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

• sug: kalign

  Globalne i progresywne dopasowywanie wielu sekwencji

• sug: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie jalview

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	9 060,4 KiB	9 592,0 KiB	[lista plików]