Pakiet: damapper (0.0+git20240314.b025cf9-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: damapper  ]

long read to reference genome mapping tool

Recognised as the Damapper Library, this is a long read to reference genome mapping command line tool.

For a given reference database 'X' and read block 'Y', damapper produces the single file 'Y.X.las'. Each output file is sorted in order of the A-reads, and if a match is a chain of local alignments, then the LA's in the chain occur in increasing order of A-coordinates.

HPC.damapper writes a UNIX shell script to the standard output that maps every read in blocks <first> to <last> of database <reads> to a reference sequence <ref>. If <last> is missing then only the single block <first> is mapped, and if <first> is also missing then all blocks of the database are mapped.

This package contains the damapper and HPC.damapper binaries.

Inne pakiety związane z damapper

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie arm64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

Pobieranie damapper

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	0.0+git20240314.b025cf9-1	109,3 KiB	316,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.0+git20240314.b025cf9-1+b1	96,5 KiB	365,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.0+git20240314.b025cf9-1	97,4 KiB	226,0 KiB	[lista plików]
i386	0.0+git20240314.b025cf9-1	109,5 KiB	346,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.0+git20240314.b025cf9-1	112,4 KiB	428,0 KiB	[lista plików]
riscv64	0.0+git20240314.b025cf9-1	106,6 KiB	248,0 KiB	[lista plików]
s390x	0.0+git20240314.b025cf9-1	116,5 KiB	336,0 KiB	[lista plików]