Pakiet: coot (1.1.18+dfsg-4)

[ Pakiet źródłowy: coot  ]

Program do budowania modeli związanych z krystalografią makrocząsteczkową

Jest to program służący do konstruowania modeli atomowych makrocząsteczek w oparciu o dane dyfrakcji rentgenowskiej. Coot wyświetla mapy gęstości elektronowej i modele molekularne oraz umożliwia zarządzania modelami, np. idealizację, oczyszczanie, ręczne obracanie/przesuwanie, dopasowywanie ciał sztywnych, wyszukiwanie ligandów, solwatację, mutacje i rotamery. Użytkownik ma dostęp do narzędzi walidacyjnych, takich jak Ramachandran i wykresy geometryczne. Ten pakiet zawiera wersję programu Coot z wbudowaną obsługą języka Python.

Inne pakiety związane z coot

• dep: coot-data

  Różne pliki danych potrzebne programowi Coot

• dep: gir1.2-gtk-4.0

  Biblioteka GTK do tworzenia graficznego interfejsu użytkownika - dowiązania gir

• dep: libasound2t64 (>= 1.0.16)

  Biblioteka współdzielona do aplikacji ALSA
  również pakiet wirtualny udostępniany przez liboss4-salsa-asound2

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [riscv64]

  Biblioteka wsparcia zapewniająca wbudowane funkcje __atomic

• dep: libblas3

  Implementacje Basic Linear Algebra Reference, biblioteka współdzielona

  lub libblas.so.3

  pakiet wirtualny udostępniany przez libblas3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libboost-python1.83.0 (>= 1.83.0)

  Boost.Python Library

• dep: libboost-python1.83.0-py313

  pakiet wirtualny udostępniany przez libboost-python1.83.0

• dep: libc6 (>= 2.38)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libcairo2 (>= 1.6.0)

  Cairo - biblioteka do dwuwymiarowej grafiki wektorowej

• dep: libclipper2 (>= 2.1.20201109)

  object oriented library for crystallographic computing

• dep: libcootapi1.1 (>= 1.1.18+dfsg)

  shared library for coot

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2)

  Łatwa w użyciu biblioteka klienta do transferu adresów URL (wersja GnuTLS)

• dep: libepoxy0 (>= 1.3)

  Biblioteka do zarządzania wskaźnikami funkcji OpenGL

• dep: libfreetype6 (>= 2.2.1)

  Silnik czcionek FreeType 2, pliki biblioteki współdzielonej

• dep: libgcc-s1 (>= 4.0)

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.31.1)

  Biblioteka GDK Pixbuf

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.80.0)

  Glib, biblioteka funkcji języka C

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libgraphene-1.0-0 (>= 1.5.4)

  Biblioteka graficznych typów danych

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgtk-4-1 (>= 4.13.8)

  Biblioteka GTK do tworzenia graficznego interfejsu użytkownika

• dep: libmmdb2-0 (>= 2.0.22)

  macromolecular coordinate library - runtime

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Rozmieszeczenie i rendering umiędzynarodowionego tekstu

• dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Rozmieszeczenie i rendering umiędzynarodowionego tekstu

• dep: libpng16-16t64 (>= 1.6.46)

  Biblioteka PNG - uruchomieniowa (wersja 1.6)

• dep: libpython3.13 (>= 3.13.0~rc3)

  Shared Python runtime library (version 3.13)

• dep: librdkit1t64 (>= 202503.6)

  Collection of cheminformatics and machine-learning software (shared libraries)

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Biblioteka współdzielona SQLite 3

• dep: libssm2 (>= 1.4.0)

  macromolecular superposition library - runtime

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: libvorbisfile3 (>= 1.1.2)

  Wysokopoziomowe API do uniwersalnego kodeka kompresji dźwięku Vorbis

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

  dep: python3 (<< 3.14)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-gi

  Dowiązania Python 3 dla bibliotek obsługujących introspekcję gobject

• dep: python3-rdkit

  Collection of cheminformatics and machine-learning software

• dep: refmac-dictionary

  dictionary for macromolecular refinement and model building

• dep: sfftw2 (>= 2.1.5)

  library for computing Fast Fourier Transforms

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

• sug: coot-doc

  Dokumentacja do programu Coot

Pobieranie coot

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	9 670,7 KiB	35 440,0 KiB	[lista plików]
arm64	8 165,5 KiB	33 181,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	9 538,2 KiB	39 193,0 KiB	[lista plików]
riscv64	9 277,6 KiB	27 854,0 KiB	[lista plików]