Pakiet: assemblytics (1.2.1+dfsg-2)

[ Pakiet źródłowy: assemblytics  ]

Wykrywanie i analizowanie wariantów strukturalnych z zestawów genomów

Assemblytics stosuje unikatowe podejście do filtrowania kotwicowego w celu zwiększenia odporności na powtarzające się elementy i identyfikuje sześć klas wariantów na podstawie ich odrębnych sygnatur wyrównania. Assemblytics można stosować zarówno do porównywania aberracyjnych genomów, np. ludzkich nowotworów, z odniesieniem, jak i do identyfikowania różnic pomiędzy spokrewnionymi gatunkami.

Inne pakiety związane z assemblytics

• dep: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• dep: python3-numpy

  Biblioteka Pythona do obliczeń numerycznych (Python 3)

• dep: r-base-core

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-cran-ggplot2

  Implementacja gramatyki grafiki

• dep: r-cran-plyr

  tools for splitting, applying and combining data

• dep: r-cran-rcolorbrewer

  GNU R package providing suitable color palettes

• rec: mummer

  Efficient sequence alignment of full genomes

Pobieranie assemblytics

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	18,2 KiB	84,0 KiB	[lista plików]