Pakiet: stacks-web (2.2+dfsg-1)

[ Pakiet źródłowy: stacks  ]

web interface for displaying loci from short-read sequences

Stacks is a software pipeline for building loci from short-read sequences, such as those generated on the Illumina platform. Stacks was developed to work with restriction enzyme-based data, such as RAD-seq, for the purpose of building genetic maps and conducting population genomics and phylogeography.

This package provides the web-based viewer which you can use to examine Stacks output that has been loaded into a MySQL database.

Inne pakiety związane z stacks-web

• dep: apache2

  Serwer HTTP Apache

  lub httpd

  pakiet wirtualny udostępniany przez apache2, ebhttpd, lighttpd, micro-httpd, mini-httpd, nginx-extras, nginx-full, nginx-light, tntnet, webfs, yaws

• dep: default-mysql-server

  MySQL database server binaries and system database setup (metapackage)

  lub virtual-mysql-server

  pakiet wirtualny udostępniany przez mariadb-server-10.3

• dep: libapache2-mod-php

  server-side, HTML-embedded scripting language (Apache 2 module) (default)
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libapache2-mod-php7.3

  lub php-cgi

  server-side, HTML-embedded scripting language (CGI binary) (default)
  również pakiet wirtualny udostępniany przez php7.3-cgi

• dep: libdbd-mysql-perl

  Perl5 database interface to the MariaDB/MySQL database

• dep: php-mdb2-driver-mysql

  mysql MDB2 driver

• rec: stacks

  pipeline for building loci from short-read DNA sequences

Pobieranie stacks-web

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
all	87,0 KiB	381,0 KiB	[lista plików]