Pakiet: sniffles (1.0.11+ds-1)

[ Pakiet źródłowy: sniffles  ]

structural variation caller using third-generation sequencing

Sniffles is a structural variation (SV) caller using third-generation sequencing data such as those from Pacific Biosciences or Oxford Nanopore platforms. It detects all types of SVs using evidence from split-read alignments, high-mismatch regions, and coverage analysis.

Inne pakiety związane z sniffles

• dep: libbamtools2.5.1

  dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [nie armhf]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

Pobieranie sniffles

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	186,2 KiB	621,0 KiB	[lista plików]
arm64	167,5 KiB	529,0 KiB	[lista plików]
armhf	166,5 KiB	376,0 KiB	[lista plików]
i386	200,6 KiB	652,0 KiB	[lista plików]