Pakiet: amap-align (2.2+git20080214.600fc29+dfsg-1)

[ Pakiet źródłowy: amap-align  ]

Wielokrotne wyrównywanie białek poprzez sekwencyjne wyżarzanie

AMAP jest narzędziem wiersza poleceń do wykonywania wielu wyrównań sekwencji peptydowych. Wykorzystuje dekodowanie typu posterior oraz wyrównywanie wyżarzonych sekwencji zamiast tradycyjnej metody stopniowego wyrównywania. Jest to jedyny program do kontrolowania czułości i specyficzności. Opiera się na kodzie źródłowym programu ProbCons, ale w odróżnieniu od niego korzysta z metody AMC (Alignment Metric Accuracy) i eliminuje przekształcanie konsystencji.

Narzędzie do wizualizacji AMAP 2.2 (napisane w języku Java) nie zostało jeszcze spakowane dla systemu Debian.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::analysing, use::comparing, Obsługa formatu: Czysty tekst, Działa z: Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z amap-align

• dep: libc6 (>= 2.27)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [nie armhf]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

Pobieranie amap-align

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	128,3 KiB	281,0 KiB	[lista plików]
arm64	126,2 KiB	257,0 KiB	[lista plików]
armhf	101,4 KiB	181,0 KiB	[lista plików]
i386	108,9 KiB	245,0 KiB	[lista plików]