Pakiet: abyss (2.1.5-7)

[ Pakiet źródłowy: abyss  ]

Nowy, równoległy, sekwencyjny asembler do krótkich odczytów

ABySS jest nowym, równoległym asemblerem sekwencji, przeznaczonym do krótkich odczytów. Może być używany do złożenia danych genomu lub transkryptomeksji. Równoległość osiągana jest za pomocą: MPI, OpenMP i pthread.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Zaimplementowane w: C, Interfejs użytkownika: Wiersz poleceń, Rola: Program

Inne pakiety związane z abyss

• dep: bsdmainutils

  Kolekcja narzędzi pochodzących z FreeBSD

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.28) [armhf, i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64, arm64]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libopenmpi3

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Biblioteka współdzielona SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: make

  Narzędzie do zarządzania procesem kompilacji

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

• dep: openmpi-common

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

Pobieranie abyss

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	2 885,5 KiB	8 774,0 KiB	[lista plików]
arm64	2 716,8 KiB	8 114,0 KiB	[lista plików]
armhf	2 724,5 KiB	6 470,0 KiB	[lista plików]
i386	2 960,8 KiB	9 334,0 KiB	[lista plików]