Pakiet: python-htseq (0.11.2-1)

Odnośniki dla python-htseq

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego htseq:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [www-huber.embl.de]

Podobne pakiety:

Python high-throughput genome sequencing read analysis utilities

HTSeq can be used to performing a number of common analysis tasks when working with high-throughput genome sequencing reads:

  * Getting statistical summaries about the base-call quality scores to
    study the data quality.
  * Calculating a coverage vector and exporting it for visualization in
    a genome browser.
  * Reading in annotation data from a GFF file.
  * Assigning aligned reads from an RNA-Seq experiments to exons and
    genes.

This package contains the Python 2 module.

Pakiety udostępniające python-htseq

python3-htseq: Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities

Inne pakiety związane z python-htseq

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libstdc++6 (>= 5)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: python

Interaktywny, wysokopoziomowy język obiektowy (wersja Python2)

dep: python (<< 2.8)

dep: python (>= 2.7)
dep: python-numpy

Szybkie dodawanie obiektów tablicy, moduł do języka Python
dep: python-pysam

interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 2)

Pobieranie python-htseq

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	226,0 KiB	791,0 KiB	[lista plików]
arm64	187,5 KiB	760,0 KiB	[lista plików]