wszystkie opcje
stretch  ] [  buster  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: libfastahack  ]

Pakiet: libfastahack0 (0.0+git20160702.bbc645f+dfsg-6)

Odnośniki dla libfastahack0

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego libfastahack:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features:

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

This package contains the dynamic library.

Inne pakiety związane z libfastahack0

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie libfastahack0

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 23,7 KiB83,0 KiB [lista plików]
arm64 22,6 KiB79,0 KiB [lista plików]
armel 20,1 KiB60,0 KiB [lista plików]
armhf 20,3 KiB52,0 KiB [lista plików]
i386 24,5 KiB72,0 KiB [lista plików]
mips 22,2 KiB74,0 KiB [lista plików]
mips64el 22,8 KiB82,0 KiB [lista plików]
mipsel 22,4 KiB74,0 KiB [lista plików]
ppc64el 25,0 KiB91,0 KiB [lista plików]
s390x 21,6 KiB76,0 KiB [lista plików]