Pakiet: dnaclust (3-6 i inne)

[ Pakiet źródłowy: dnaclust  ]

tool for clustering millions of short DNA sequences

dnaclust is a tool for clustering large number of short DNA sequences. The clusters are created in such a way that the "radius" of each clusters is no more than the specified threshold.

The input sequences to be clustered should be in Fasta format. The id of each sequence is based on the first word of the seqeunce in the Fasta format. The first word is the prefix of the header up to the first occurrence of white space characters in the header.

Znaczniki: Biologia: Fasta/Pearson, Kwasy nukleinowe, Dziedzina: field::biology, field::biology:bioinformatics, Zaimplementowane w: C++, Rola: role::program, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z dnaclust

• dep: libboost-program-options1.67.0

  program options library for C++

• dep: libc6 (>= 2.4)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

Pobieranie dnaclust

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
i386	3-6+b1	88,7 KiB	318,0 KiB	[lista plików]