Pakiet: skesa (2.4.0-1)

[ Pakiet źródłowy: skesa  ]

strategic Kmer extension for scrupulous assemblies

SKESA is a DeBruijn graph-based de-novo assembler designed for assembling reads of microbial genomes sequenced using Illumina. Comparison with SPAdes and MegaHit shows that SKESA produces assemblies that have high sequence quality and contiguity, handles low-level contamination in reads, is fast, and produces an identical assembly for the same input when assembled multiple times with the same or different compute resources. SKESA has been used for assembling over 272,000 read sets in the Sequence Read Archive at NCBI and for real-time pathogen detection.

Inne pakiety związane z skesa

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libncbi-vdb2 (>= 2.10.6+dfsg)

  libraries for using data in the INSDC Sequence Read Archives

• dep: libstdc++6 (>= 7)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie skesa

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	688,1 KiB	2 662,0 KiB	[lista plików]
i386	745,7 KiB	3 100,0 KiB	[lista plików]