wszystkie opcje
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: r-cran-ape  ]

Pakiet: r-cran-ape (5.4-1-1)

Odnośniki dla r-cran-ape

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego r-cran-ape:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

GNU R package for Analyses of Phylogenetics and Evolution

This package provides functions for reading, writing, plotting, and manipulating phylogenetic trees, analyses of comparative data in a phylogenetic framework, ancestral character analyses, analyses of diversification and macroevolution, computing distances from DNA sequences, reading and writing nucleotide sequences as well as importing from BioConductor, and several tools such as Mantel's test, generalized skyline plots, graphical exploration of phylogenetic data (alex, trex, kronoviz), estimation of absolute evolutionary rates and clock-like trees using mean path lengths and penalized likelihood, dating trees with non-contemporaneous sequences, translating DNA into AA sequences, and assessing sequence alignments. Phylogeny estimation can be done with the NJ, BIONJ, ME, MVR, SDM, and triangle methods, and several methods handling incomplete distance matrices (NJ*, BIONJ*, MVR*, and the corresponding triangle method). Some functions call external applications (PhyML, Clustal, T-Coffee, Muscle) whose results are returned into R.

Znaczniki: Rozwój oprogramowania: Rozwijanie w języku GNU R, Dziedzina: Statystyka, Zaimplementowane w: GNU R

Inne pakiety związane z r-cran-ape

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie r-cran-ape

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
mipsel 2 146,3 KiB2 514,0 KiB [lista plików]