Pakiet: bppsuite (2.4.1-3)

[ Pakiet źródłowy: bppsuite  ]

Bio++ program suite

The Bio++ Program Suite is a package of programs using the Bio++ libraries and dedicated to Phylogenetics and Molecular Evolution. All programs are independent, but can be combined to perform rather complex analyses. These programs use the interface helper tools of the libraries, and hence share the same syntax. They also have several options in common, which may also be shared by third-party software.

The following programs are included:

 - BppML for maximum likelihood analysis,
 - BppSeqGen for sequences simulation,
 - BppAncestor for ancestral states reconstruction,
 - BppDist for distance methods,
 - BppPars for parsimony analysis,
 - BppSeqMan for file conversion and sequence manipulation,
 - BppConsense for building consensus tree and computing
   bootstrap values,
 - BppReRoot for tree rerooting.
 - BppTreeDraw for tree drawing.
 - BppAlnScore for comparing alignments and computing alignment scores.
 - BppMixedLikelihoods for computing site per site likelihoods of
   components of mixture models.
 - BppPopGen for population genetics analyses.

Inne pakiety związane z bppsuite

• dep: libbpp-core4 (>= 2.4.1)

  Bio++ Core library

• dep: libbpp-phyl12 (>= 2.4.1)

  Bio++ Phylogenetic library

• dep: libbpp-popgen8 (>= 2.4.1)

  Bio++ Population Genetics library

• dep: libbpp-seq12 (>= 2.4.1)

  Bio++ Sequence library

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 10.2.0-7) [armel]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [nie armel]

• sug: bppsuite-examples

  Examples for Bio++ program suite

Pobieranie bppsuite

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	375,9 KiB	1 994,0 KiB	[lista plików]
arm64	345,7 KiB	1 922,0 KiB	[lista plików]
armel	312,1 KiB	1 550,0 KiB	[lista plików]
armhf	321,7 KiB	1 278,0 KiB	[lista plików]
i386	378,9 KiB	1 862,0 KiB	[lista plików]
mips64el	340,8 KiB	2 226,0 KiB	[lista plików]
mipsel	340,7 KiB	2 026,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	371,8 KiB	2 614,0 KiB	[lista plików]
s390x	338,6 KiB	2 018,0 KiB	[lista plików]