Pakiet: autodock (4.2.6-8)

[ Pakiet źródłowy: autodocksuite  ]

analysis of ligand binding to protein structure

AutoDock is a prime representative of the programs addressing the simulation of the docking of fairly small chemical ligands to rather big protein receptors. Earlier versions had all flexibility in the ligands while the protein was kept rather ridgid. This latest version 4 also allows for a flexibility of selected sidechains of surface residues, i.e., takes the rotamers into account.

The AutoDock program performs the docking of the ligand to a set of grids describing the target protein. AutoGrid pre-calculates these grids.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Biologia strukturalna, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::analysing, works-with-format::TODO, Działa z: Modele 3D, Wymaga dodatkowego znacznika

Inne pakiety związane z autodock

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nie armel, armhf, ppc64el]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• sug: autodocktools

  Pakiet niedostępny

• sug: autogrid

  Wstępnie obliczanie wiązania ligandów z ich receptorem

Pobieranie autodock

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	162,9 KiB	411,0 KiB	[lista plików]
arm64	151,1 KiB	375,0 KiB	[lista plików]
armel	157,3 KiB	407,0 KiB	[lista plików]
armhf	152,2 KiB	315,0 KiB	[lista plików]
i386	161,4 KiB	411,0 KiB	[lista plików]
mips64el	165,2 KiB	460,0 KiB	[lista plików]
mipsel	170,5 KiB	454,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	162,9 KiB	435,0 KiB	[lista plików]
s390x	149,3 KiB	399,0 KiB	[lista plików]