Pakiet: delly (1.1.6-1)

[ Pakiet źródłowy: delly  ]

Structural variant discovery by read analysis

Delly performs Structural variant discovery by integrated paired-end and split-read analysis. It discovers, genotypes and visualizes deletions, tandem duplications, inversions and translocations at single-nucleotide resolution in short-read massively parallel sequencing data. It uses paired-ends, split-reads and read-depth to sensitively and accurately delineate genomic rearrangements throughout the genome.

Inne pakiety związane z delly

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  Biblioteka Boost.Iostreams

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

  program options library for C++

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, mips64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [mipsel]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

Pobieranie delly

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	321,3 KiB	987,0 KiB	[lista plików]
arm64	277,9 KiB	915,0 KiB	[lista plików]
armel	258,1 KiB	850,0 KiB	[lista plików]
armhf	266,4 KiB	594,0 KiB	[lista plików]
i386	338,6 KiB	1 042,0 KiB	[lista plików]
mips64el	293,6 KiB	1 207,0 KiB	[lista plików]
mipsel	296,6 KiB	1 203,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	320,5 KiB	1 171,0 KiB	[lista plików]
s390x	291,7 KiB	1 027,0 KiB	[lista plików]