Pakiet: busco (5.4.4-1)

Odnośniki dla busco

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego busco:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [gitlab.com]

Podobne pakiety:

Porównywanie zestawów uniwersalnych ortologów jednokopiowych

Ocena złożenia genomu i kompletności adnotacji za pomocą BUSCO (Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs - Porównywania uniwersalnych ortologów jednokopiowych).

 * Automatyczny wybór linii rodowych z https://www.orthodb.org/.
 * Automatyczne pobieranie wszystkich niezbędnych plików i zestawów
   danych do przeprowadzenia przebiegu.
 * Stosowanie narzędzia prodigal dla genomów nieeukariotycznych.

Inne pakiety związane z busco

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: bbmap

BBTools genomic aligner and other tools for short sequences
dep: hmmer

profile hidden Markov models for protein sequence analysis
dep: prodigal

Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program
dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
dep: python3-biopython

Python3 library for bioinformatics
dep: python3-pandas

data structures for "relational" or "labeled" data

Pobieranie busco

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	70,1 KiB	410,0 KiB	[lista plików]
i386	70,1 KiB	410,0 KiB	[lista plików]