Pakiet: bitseq (0.7.5+dfsg-6)

[ Pakiet źródłowy: bitseq  ]

Bayesian Inference of Transcripts from Sequencing Data

BitSeq is an application for inferring expression levels of individual transcripts from sequencing (RNA-Seq) data and estimating differential expression (DE) between conditions. An advantage of this approach is the ability to account for both technical uncertainty and intrinsic biological variance in order to avoid false DE calls. The technical contribution to the uncertainty comes both from finite read-depth and the possibly ambiguous mapping of reads to multiple transcripts.

Inne pakiety związane z bitseq

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, mipsel, s390x]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python 3 language

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

• sug: samtools

  Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

Pobieranie bitseq

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	337,2 KiB	1 927,0 KiB	[lista plików]
arm64	298,0 KiB	1 691,0 KiB	[lista plików]
armel	282,4 KiB	1 606,0 KiB	[lista plików]
armhf	286,8 KiB	1 158,0 KiB	[lista plików]
i386	362,5 KiB	2 022,0 KiB	[lista plików]
mips64el	320,9 KiB	2 167,0 KiB	[lista plików]
mipsel	324,2 KiB	2 080,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	343,5 KiB	2 471,0 KiB	[lista plików]
s390x	297,6 KiB	1 955,0 KiB	[lista plików]