Pakiet: biobambam2 (2.0.185+ds-1)

[ Pakiet źródłowy: biobambam2  ]

tools for early stage alignment file processing

This package contains some tools for processing BAM files, including

  bamsormadup:  parallel sorting and duplicate marking
  bamcollate2:  reads BAM and writes BAM reordered such that alignment
                or collated by query name
  bammarkduplicates: reads BAM and writes BAM with duplicate alignments
                marked using the BAM flags field
  bammaskflags: reads BAM and writes BAM while masking (removing) bits
                from the flags column
  bamrecompress: reads BAM and writes BAM with a defined compression
                 setting. This tool is capable of multi-threading.
  bamsort:       reads BAM and writes BAM resorted by coordinates or
                 query name
  bamtofastq:    reads BAM and writes FastQ; output can be collated
                 or uncollated by query name

Inne pakiety związane z biobambam2

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libmaus2-2 (>= 2.0.813+ds)

  collection of data structures and algorithms for biobambam

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie biobambam2

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	9 346,1 KiB	64 727,0 KiB	[lista plików]
arm64	8 478,3 KiB	63 459,0 KiB	[lista plików]
i386	9 987,0 KiB	72 831,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	9 189,8 KiB	78 371,0 KiB	[lista plików]