Pakiet: python3-pyani (0.2.12-2)

[ Pakiet źródłowy: python-pyani  ]

Python3 module for average nucleotide identity analyses

Pyani is a Python3 module and script that provides support for calculating average nucleotide identity (ANI) and related measures for whole genome comparisons, and rendering relevant graphical summary output. Where available, it takes advantage of multicore systems, and can integrate with SGE/OGE-type job schedulers for the sequence comparisons.

Inne pakiety związane z python3-pyani

• dep: mummer

  Efficient sequence alignment of full genomes

• dep: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• dep: python3-biopython

  Python3 library for bioinformatics

• dep: python3-matplotlib

  Python based plotting system in a style similar to Matlab (Python 3)

• dep: python3-pandas

  data structures for "relational" or "labeled" data

• dep: python3-scipy

  scientific tools for Python 3

• dep: python3-seaborn

  statistical visualization library for Python3

• dep: python3-setuptools

  Python3 Distutils Enhancements

Pobieranie python3-pyani

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	47,0 KiB	207,0 KiB	[lista plików]
arm64	47,0 KiB	207,0 KiB	[lista plików]
armel	47,0 KiB	207,0 KiB	[lista plików]
armhf	47,0 KiB	207,0 KiB	[lista plików]
i386	47,0 KiB	207,0 KiB	[lista plików]
mips64el	47,0 KiB	207,0 KiB	[lista plików]
mipsel	47,0 KiB	207,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	47,0 KiB	207,0 KiB	[lista plików]
s390x	47,0 KiB	207,0 KiB	[lista plików]