Pakiet: python3-dna-jellyfish (2.3.0-15 i inne)
Odnośniki dla python3-dna-jellyfish
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego jellyfish:
Opiekunowie:
- Debian Med Packaging Team (Strona QA, Archiwum e-mail)
- Shaun Jackman (Strona QA)
- Andreas Tille (Strona QA)
- Michael R. Crusoe (Strona QA)
- Étienne Mollier (Strona QA)
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [github.com]
Podobne pakiety:
count k-mers in DNA sequences (Python bindings of jellyfish)
JELLYFISH is a tool for fast, memory-efficient counting of k-mers in DNA. A k-mer is a substring of length k, and counting the occurrences of all such substrings is a central step in many analyses of DNA sequence. JELLYFISH can count k-mers using an order of magnitude less memory and an order of magnitude faster than other k-mer counting packages by using an efficient encoding of a hash table and by exploiting the "compare-and-swap" CPU instruction to increase parallelism.
JELLYFISH is a command-line program that reads FASTA and multi-FASTA files containing DNA sequences. It outputs its k-mer counts in an binary format, which can be translated into a human-readable text format using the "jellyfish dump" command.
This package contains the Python bindings of jellyfish.
Inne pakiety związane z python3-dna-jellyfish
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, i386]
- Biblioteka wspomagająca GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
-
- dep: libjellyfish-2.0-2 (>= 2.3.0)
- count k-mers in DNA sequences (dynamic library of jellyfish)
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]
- Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
- dep: libstdc++6 (>= 9) [nie armel, armhf]
-
- dep: python3
- Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
- dep: python3 (<< 3.12)
- dep: python3 (>= 3.11~)
Pobieranie python3-dna-jellyfish
Architektura | Wersja | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
---|---|---|---|---|
amd64 | 2.3.0-15+b3 | 52,1 KiB | 175,0 KiB | [lista plików] |
arm64 | 2.3.0-15+b3 | 49,6 KiB | 171,0 KiB | [lista plików] |
armel | 2.3.0-15+b3 | 51,9 KiB | 168,0 KiB | [lista plików] |
armhf | 2.3.0-15+b3 | 52,8 KiB | 140,0 KiB | [lista plików] |
i386 | 2.3.0-15+b3 | 60,5 KiB | 184,0 KiB | [lista plików] |
mips64el | 2.3.0-15+b3 | 50,5 KiB | 242,0 KiB | [lista plików] |
ppc64el | 2.3.0-15+b3 | 55,1 KiB | 235,0 KiB | [lista plików] |