wszystkie opcje
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: plip  ]

Pakiet: plip (2.2.2+dfsg-1)

Odnośniki dla plip

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego plip:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

fully automated protein-ligand interaction profiler

The Protein-Ligand Interaction Profiler (PLIP) is a tool to analyze and visualize protein-ligand interactions in PDB files.

Features include:

 * Detection of eight different types of noncovalent interactions
 * Automatic detection of relevant ligands in a PDB file
 * Direct download of PDB structures from wwPDB server if valid
   PDB ID is given
 * Processing of custom PDB files containing protein-ligand complexes
   (e.g. from docking)
 * No need for special preparation of a PDB file, works out of the box
 * Atom-level interaction reports in rST and XML formats for easy parsing
 * Generation of PyMOL session files (.pse) for each pairing, enabling easy
   preparation of images for publications and talks
 * Rendering of preview image for each ligand and its interactions
   with the protein

Inne pakiety związane z plip

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie plip

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
all 82,3 KiB383,0 KiB [lista plików]