all options
wheezy  ] [  jessie  ] [  sid  ]
[ Source: bowtie  ]

Package: bowtie (0.12.7-3)

Links for bowtie

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package bowtie:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

ultrasnelle, geheugenzuinige short-read aligner

Dit pakket helpt bij de problemen die ontstaan bij het interpreteren van de laatste (2010) sequencing-technieken. Deze geven alleen korte sequenties, die niet direct geïnterpreteerd worden. De uitdaging voor programma's zoals Bowtie is om voor elke run de chomosomale locatie van de gegeven DNA-sequentie te vinden

Bowtie aligns korte DNA-sequenties (reads) van het menselijke genoom met een snelheid boven de 25 miljoen 35-bp reads per uur. Bowtie indexeert het genoom met een Burrows-Wheeler index om het geheugengebruik laat te houden: meestal zo'n 2.2 GB voor het menselijke genoom (2.9 GB voor paired-end).

Tags: Field: Biology, Implemented in: C++, User Interface: interface::commandline, role::program, Scope: Utility, Purpose: Analysing, use::comparing, works-with::biological-sequence

Other Packages Related to bowtie

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download bowtie

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
i386 1,251.1 kB3,291.0 kB [list of files]