alle opties
wheezy  ] [  sid  ]
[ Bron: bowtie  ]

Pakket: bowtie (0.12.7-3)

Verwijzigingen voor bowtie

Screenshot

Debian bronnen:

Het bronpakket bowtie downloaden:

Beheerders:

Externe bronnen:

Vergelijkbare pakketten:

ultrasnelle, geheugenzuinige short-read aligner

Dit pakket helpt bij de problemen die ontstaan bij het interpreteren van de laatste (2010) sequencing-technieken. Deze geven alleen korte sequenties, die niet direct geïnterpreteerd worden. De uitdaging voor programma's zoals Bowtie is om voor elke run de chomosomale locatie van de gegeven DNA-sequentie te vinden

Bowtie aligns korte DNA-sequenties (reads) van het menselijke genoom met een snelheid boven de 25 miljoen 35-bp reads per uur. Bowtie indexeert het genoom met een Burrows-Wheeler index om het geheugengebruik laat te houden: meestal zo'n 2.2 GB voor het menselijke genoom (2.9 GB voor paired-end).

Tags: Field: Biology, Implemented in: C++, User Interface: interface::commandline, role::program, Scope: Utility, Purpose: Analysing, use::comparing, works-with::biological-sequence

Andere aan bowtie gerelateerde pakketten

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

bowtie downloaden

Pakket downloaden voor alle beschikbare platforms
Platform Pakketgrootte Geïnstalleerde grootte Bestanden
i386 1.251,1 kB3.291,0 kB [overzicht]