alle opties
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Bron: bowtie  ]

Pakket: bowtie-examples (1.3.0+dfsg1-1)

Verwijzigingen voor bowtie-examples

Screenshot

Debian bronnen:

Het bronpakket bowtie downloaden:

Beheerders:

Externe bronnen:

Vergelijkbare pakketten:

Voorbeelden voor bowtie, de ultrasnelle, geheugenzuinige short-read aligner

Dit pakket helpt bij de problemen die ontstaan bij het interpreteren van de laatste (2010) sequencing-technieken. Deze geven alleen korte sequenties, die niet direct geïnterpreteerd worden. De uitdaging voor programma's zoals Bowtie is om voor elke run de chomosomale locatie van de gegeven DNA-sequentie te vinden

Bowtie aligns korte DNA-sequenties (reads) van het menselijke genoom met een snelheid boven de 25 miljoen 35-bp reads per uur. Bowtie indexeert het genoom met een Burrows-Wheeler index om het geheugengebruik laat te houden: meestal zo'n 2.2 GB voor het menselijke genoom (2.9 GB voor paired-end).

Dit pakket bevat wat extra voorbeelddata voor bowtie.

Andere aan bowtie-examples gerelateerde pakketten

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

bowtie-examples downloaden

Pakket downloaden voor alle beschikbare platforms
Platform Pakketgrootte Geïnstalleerde grootte Bestanden
all 6.159,9 kB6.767,0 kB [overzicht]