Pakket: lagan (2.0-6)

[ Bron: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Andere aan lagan gerelateerde pakketten

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C Bibliotheek: Gedeelde bibliotheken
  Ook een virtueel pakket geboden door: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [niet armel, armhf]

  GCC support bibliotheek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ Library v3

lagan downloaden

Pakket downloaden voor alle beschikbare platforms

Platform	Pakketgrootte	Geïnstalleerde grootte	Bestanden
amd64	174,9 kB	820,0 kB	[overzicht]
arm64	169,4 kB	736,0 kB	[overzicht]
armel	159,7 kB	665,0 kB	[overzicht]
armhf	160,2 kB	565,0 kB	[overzicht]
i386	183,8 kB	821,0 kB	[overzicht]
mips64el	179,1 kB	832,0 kB	[overzicht]
mipsel	181,0 kB	761,0 kB	[overzicht]
ppc64el	196,7 kB	1.888,0 kB	[overzicht]
s390x	170,7 kB	784,0 kB	[overzicht]