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パッケージ: kalign (1:2.03+20110620-2)

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グローバルおよびプログレッシブ多重配列アライメント

Kalign は、生物学的配列の多重アライメント実行用コマンドラインツールです。ア ライメントの正確さと速度の両方を改善するため、Muth-Manber の文字列照合アル ゴリズムを使用します。グローバルかつプログレッシブなアライメント手法を利用 しており、その上で、配列間距離の計算への近似文字列照合アルゴリズムの使用 と、ローカルのマッチを別のグローバルアライメントに組み込むことにより、機能 がさらに強化されています。

タグ: 生物学: Clustal/ALN, biology::nuceleic-acids, biology::peptidic, field::biology, 分野: バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: use::comparing, works-with-format::plaintext, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

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