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パッケージ: garlic (1.6-1.1)

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生体分子の視覚化プログラム

garlic は、膜タンパク質の調査用に書かれました。おそらく、他のタンパク質や幾 何学図形の視覚化にも使用できるでしょう。本バージョンの garlic は、PDB 形式 のバージョン 2.1 を認識します。garlic はタンパク質配列の解析にも使用できます。

X ライブラリのみに依存し、他のライブラリは不要です。

含まれている機能には以下のものがあります:

 - 断面の位置と厚さは小さなウィンドウに表示されます。
 - 原子結合は、原子と同じように独立した描画オブジェクトとして扱われます。
 - 原子と結合の色は位置に依存します。5 種類のマッピングモードがあります (断
   面ごと)。
 - 立体画像を表示できます。
 - 膜のような他の幾何学図形を表示できます。
 - マウスポインタで示した原子の原子情報が表示されます。クリックは不要です。
   マウスポインタを重ねるだけです!
 - 複数の構造をロードできます。
 - ラマチャンドランプロット、ヘリカルホイール、ベン図、平均疎水性や疎水性
   モーメントプロットを描画できます。
 - メインウィンドウ下部にコマンドプロンプトがあります。
   1 行のエラーメッセージと、1 つのコマンド文字列を表示できます。

タグ: 分野: 生物学, 化学, ユーザインタフェース: X ウィンドウシステム, 役割: role::program, scope::utility, インタフェースツールキット: X ライブラリ, 目的: データの可視化, X ウィンドウシステム: アプリケーション

その他の garlic 関連パッケージ

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  • 推奨
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  • enhances

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