すべてのオプション
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ ソース: pilon  ]

パッケージ: pilon (1.24-3)

pilon に関するリンク

Screenshot

Debian の資源:

pilon ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

類似のパッケージ:

automated genome assembly improvement and variant detection tool

Pilon is a software tool which can be used to:

 * Automatically improve draft assemblies
 * Find variation among strains, including large event detection
Pilon requires as input a FASTA file of the genome along with one or more BAM files of reads aligned to the input FASTA file. Pilon uses read alignment analysis to identify inconsistencies between the input genome and the evidence in the reads. It then attempts to make improvements to the input genome, including:
 * Single base differences
 * Small indels
 * Larger indel or block substitution events
 * Gap filling
 * Identification of local misassemblies, including optional opening
   of new gaps

その他の pilon 関連パッケージ

  • 依存
  • 推奨
  • 提案
  • enhances

pilon のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
all 485.5 kB613.0 kB [ファイル一覧]