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パッケージ: hmmer (2.3.2-5)

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タンパク質配列解析用のプロファイル隠れマルコフモデル

HMMER は、プロファイル隠れマルコフモデル法の実装であり、多重配列アライメン トをクエリー (問い合わせ) として用いた生物学配列データベースの感度の高い検 索を行うためのものです。

入力として多重配列アライメントを与えると、HMMER は "隠れマルコフモデル" と 呼ばれる統計モデルを構築します。このモデルをさらにクエリーとして、配列デー タベースから、配列ファミリの追加のホモログ (相同体) を検索する (またはアラ イメントする) ことができます。

タグ: 生物学: Clustal/ALN, biology::format:fasta, タンパク質, 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: C, ユーザインタフェース: コマンドライン, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: 検索, 取り扱い対象: データベース, サポート形式: プレーンテキスト

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