all options
squeeze  ] [  wheezy  ] [  jessie  ] [  stretch  ] [  sid  ]
[ Source: hmmer  ]

Package: hmmer (2.3.2-5)

Links for hmmer


Debian Resources:

Download Source Package hmmer:


External Resources:

Similar packages:


HMMER は、プロファイル隠れマルコフモデル法の実装であり、多重配列アライメン トをクエリー (問い合わせ) として用いた生物学配列データベースの感度の高い検 索を行うためのものです。

入力として多重配列アライメントを与えると、HMMER は "隠れマルコフモデル" と 呼ばれる統計モデルを構築します。このモデルをさらにクエリーとして、配列デー タベースから、配列ファミリの追加のホモログ (相同体) を検索する (またはアラ イメントする) ことができます。

Tags: Biology: Clustal/ALN, biology::format:fasta, Proteins, Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: Searching, Works with: Databases, Supports Format: Plain Text

Other Packages Related to hmmer

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Download hmmer

Download for all available architectures
Architecture Package Size Installed Size Files
sparc 1,069.2 kB2,272.0 kB [list of files]