パッケージ: fastani (1.33-3) [debports]
Fast alignment-free computation of whole-genome Average Nucleotide Identity
ANI is defined as mean nucleotide identity of orthologous gene pairs shared between two microbial genomes. FastANI supports pairwise comparison of both complete and draft genome assemblies.
その他の fastani 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.4)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
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- dep: libgsl27 (>= 2.7.1)
- GNU Scientific Library (GSL) -- library package
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- dep: libgslcblas0 (>= 2.7.1)
- GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
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- rec: r-cran-genoplotr
- Plot Publication-Grade Gene and Genome Maps