パッケージ: blixem (4.44.1+dfsg-7.1) [debports]
blixem に関するリンク
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外部の資源:
- ホームページ [www.sanger.ac.uk]
類似のパッケージ:
interactive browser of sequence alignments
Blixem is an interactive browser of sequence alignments that have been stacked up in a "master-slave" multiple alignment; it is not a 'true' multiple alignment but a 'one-to-many' alignment.
* Overview section showing the positions of genes and alignments around the alignment window * Detail section showing the actual alignment of protein or nucleotide sequences to the genomic DNA sequence. * View alignments against both strands of the reference sequence. * View sequences in nucleotide or protein mode; in protein mode, Blixem will display the three-frame translation of the reference sequence. * Residues are highlighted in different colours depending on whether they are an exact match, conserved substitution or mismatch. * Gapped alignments are supported, with insertions and deletions being highlighted in the match sequence. * Matches can be sorted and filtered. * SNPs and other variations can be highlighted in the reference sequence. * Poly(A) tails can be displayed and poly(A) signals highlighted in the reference sequence.
その他の blixem 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.37)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libcairo2 (>= 1.2.4)
- Cairo 二次元ベクトルグラフィックライブラリ
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- dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2)
- 使いやすいクライアントサイドの URL 転送ライブラリ (OpenSSL フレーバ)
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- dep: libgbtools0t64 (>= 4.44.1+dfsg)
- library for visualising sequence alignments
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3)
- C ルーチンの GLib ライブラリ
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- dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.14.0)
- GTK graphical user interface library - old version
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- dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)
- 国際化されたテキストのレイアウトと描画
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- dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)
- SQLite 3 共有ライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3