[ ソース: unikmer ]
パッケージ: unikmer (0.19.1-1 など)
Toolkit for nucleic acid k-mer analysis
unikmer is a golang package and a toolkit for nucleic acid k-mer analysis, providing functions including set operation k-mers optional with TaxIDs but without count information.
K-mers are either encoded (k<=32) or hashed (arbitrary k) into uint64, and serialized in binary file with extension .unik.
TaxIDs can be assigned when counting k-mers from genome sequences, and LCA (Lowest Common Ancestor) is computed during set opertions including computing union, intersecton, set difference, unique and repeated k-mers.
その他の unikmer 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
unikmer のダウンロード
| アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 0.19.1-1+b6 | 2,556.5 kB | 8,125.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 0.19.1-1+b6 | 2,193.8 kB | 7,741.0 kB | [ファイル一覧] |
| armel | 0.19.1-1+b6 | 2,194.4 kB | 7,727.0 kB | [ファイル一覧] |
| armhf | 0.19.1-1+b6 | 2,185.4 kB | 7,695.0 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 0.19.1-1+b6 | 2,373.0 kB | 7,760.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 0.19.1-1+b6 | 1,983.0 kB | 8,912.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 0.19.1-1+b6 | 2,181.8 kB | 7,932.0 kB | [ファイル一覧] |
| riscv64 | 0.19.1-1+b4 | 2,226.1 kB | 7,829.0 kB | [ファイル一覧] |
| s390x | 0.19.1-1+b6 | 2,329.0 kB | 8,581.0 kB | [ファイル一覧] |