パッケージ: quorum (1.1.2-2 など)

[ ソース: quorum  ]

QUality Optimized Reads of genomic sequences

QuorUM enables to obtain trimmed and error-corrected reads that result in assemblies with longer contigs and fewer errors. QuorUM provides best performance compared to other published error correctors in several metrics. QuorUM is efficiently implemented making use of current multi- core computing architectures and it is suitable for large data sets (1 billion bases checked and corrected per day per core). The third-party assembler (SOAPdenovo) benefits significantly from using QuorUM error- corrected reads. QuorUM error corrected reads result in a factor of 1.1 to 4 improvement in N50 contig size compared to using the original reads with SOAPdenovo for the data sets investigated.

その他の quorum 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34) [ia64 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ia64, riscv64 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libjellyfish-2.0-2 (>= 2.3.0) [amd64, arm64, ia64]

  count k-mers in DNA sequences (dynamic library of jellyfish)

  dep: libjellyfish-2.0-2 (>= 2.3.1) [mips64el, ppc64el, riscv64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64 以外]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

quorum のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	1.1.2-2	114.5 kB	400.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.1.2-2	109.4 kB	556.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.1.1-5	136.1 kB	620.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.1.2-2+b2	115.7 kB	572.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.1.2-2+b2	116.7 kB	557.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.1.2-2+b2	114.6 kB	341.0 kB	[ファイル一覧]