パッケージ: pplacer (1.1~alpha19-6)
phylogenetic placement and downstream analysis
Pplacer places reads on a phylogenetic tree. guppy (Grand Unified Phylogenetic Placement Yanalyzer) yanalyzes them. rppr is a helpful tool for working with reference packages.
Pplacer places query sequences on a fixed reference phylogenetic tree to maximize phylogenetic likelihood or posterior probability according to a reference alignment. Pplacer is designed to be fast, to give useful information about uncertainty, and to offer advanced visualization and downstream analysis.
その他の pplacer 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.33)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgsl27 (>= 2.7.1)
- GNU Scientific Library (GSL) -- library package
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- dep: libsqlite3-0 (>= 3.25.0)
- SQLite 3 共有ライブラリ
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
pplacer のダウンロード
アーキテクチャ | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
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amd64 | 2,895.3 kB | 18,060.0 kB | [ファイル一覧] |
arm64 | 3,452.6 kB | 21,020.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64 (非公式の移植版) | 3,036.3 kB | 22,769.0 kB | [ファイル一覧] |
ppc64el | 3,054.6 kB | 20,017.0 kB | [ファイル一覧] |
riscv64 (非公式の移植版) | 2,633.1 kB | 17,330.0 kB | [ファイル一覧] |
s390x | 2,712.9 kB | 19,926.0 kB | [ファイル一覧] |